由于枯草芽孢杆菌耐受性强，在饲料制作过程中的高温高压条件下仍保持良好的稳定性和生物活性，因此，当前在饲料添加剂中应用较多。

促进肠道有益厌氧菌生长，降低大肠杆菌、弧菌、杆状病菌数量，增强抗应激能力，有效防止腹泻（痢疾）、便秘，减少疾病发生。

本菌可产生有机酸、多种酶（淀粉酶、脂肪酶和蛋白酶等）、B族维生素，促进消化吸收，提高饲料转化率。

本菌在生长过程中产生的伊枯草菌素、多粘菌素、制霉菌素、杆肽等多肽类活性物质和生物表面活性素等，对致病菌有抑制作用。

改善动物免疫器官生长发育，增强抗病力，提高成活率，可替代或减少抗生素使用，防止耐药菌的产生。

分解动物舍内的残渣，降解粪浆，消除臭味；降低舍内有害气体浓度，减少病原菌的排放，显著净化养殖环境。